O Parque Nacional da Serra da Bocaina conta com inúmeras opções de trilhas. Para chegar até a área preservada é necessária a autorização do Ibama e o acompanhamento de condutores. A maioria das trilhas leva até cachoeiras e quedas d'água. Entre as mais conhecidas e freqüentadas estão a de Sºao Isidro, próxima ao portão de entrada do parque, e a do Veado, no Rio Mambucaba, entre a serra e o litoral.

A Trilha do Ouro, que corta o parque na direção São José do Barreiro-Parati, é um antigo caminho colonial calçado pelos escravos com pedras de rio. Foi usado pelos tropeiros para transportar o ouro de Minas Gerais para os portos de Mambucaba e Parati, a partir do século 18. Esse caminho antigo pode ser trilhado pelos visitantes, a pé ou a cavalo. Alo longo da Trilha do Ouro existem áreas de camping selvagem.

Agências especializadas em ecoturismo na região oferecem diversos roteiros para passeios nesses recantos ricos em história e beleza natural.

Vale a pena a caminhada até um dos altos picos da Bocaina, de onde se pode ter uma visão panorâmica da Baía de Parati. O parque não conta com serviços de apoio ao turista e, por isso, as visitas devem ser comunicadas com antecedência.