Constituir uma grande vitrine com quase todos os ecosistemas que formam o riquíssimo bioma em extinção da Mata Atlântica, é a característica peculiar dessa unidade de preservação. Intercala cenários montanhosos, como as escarpas cristalinas da Serra do

Mar, e altitudes superiores, já na Serra da Bocaina, com praia litorânea e costão rochoso. Faz parte dessa paisagem, o Pico do Tira o Chapéu, um dos pontos culminantes do Estado de São Paulo, com 2.200 m de altitude.

A Serra da Bocaina está localizada entre os maciços das serras do Mar e da Mantiqueira.